老年肺癌亚专科：本专科常年收治老年且合并多种基础疾病的肺癌患者，以靶向、化疗、免疫治疗三把利刃为主，合理运用气道介入等呼吸专科技术，并联合我院肿瘤相关专业团队，进行个体化精准治疗。并针对基础疾病，联合老年病相关科室进行多学科会诊，进行个体化治疗以及全程管理。在规范化治疗的基础上，推动老年肺癌诊疗医学服务从单病种模式向多病共治模式转变，为老年肺癌患者改善生活质量、延长寿命。

        慢阻肺亚专科：本专科拥有静态和运动肺功能检测仪，致力于慢阻肺患者的诊断、治疗、随访以及康复锻炼，为每例患者提供精准治疗方案。掌握重度肺气肿患者内科肺减容治疗技术、巨大肺大泡以及难治性气胸内科治疗技术。与胸外科以及肺移植科紧密合作，承担肺移植患者术前筛查、准备以及术后治疗康复等。

        科室睡眠呼吸医学中心是华南地区建立最早、规模最大的中心之一，在阻塞性睡眠呼吸暂停低通气综合征对心脑血管等重要靶器官的损害机理、防治策略进行了系统的研究，建立了相关疾病的数据库及干预防控跟踪网络。

        呼吸系统感染亚专科：较早开展临床研究，特别在老年肺部感染的诊断与防治方面形成了在国内领先和有一定声誉的特色与优势。结合微生物实验室、药理实验室，可对感染性疾病进行早期精确诊断及用药，对疑难危重病例使用药代动力学/药效动力学（PK/PD）、分子药理学研究、整合基因组学、整合基因组学等进行精确分析。

        介入呼吸病学亚专科：本专科拥有多种导航技术如：虚拟支气管镜导航、径向气道内超声、超声内镜、冷冻活检以及现场细胞学检查等国际先进诊断技术。掌握经支气管镜下冷热消融、气道狭窄支气管球囊扩张术、气管和支气管支架置放术等领先治疗方法。在国内较早开展经支气管肺门、纵隔淋巴结穿刺活检（TBNA）、内科胸腔镜、活瓣肺减容、选择性支气管封堵术、支气管热成形术亦得到国内同行高度认可。

        哮喘亚专科：本专科拥有组织胺及运动激发试验、一氧化氮呼气测定等气道高反应性检测技术，开展哮喘及慢性咳嗽患者的诊断、治疗和随访，并进行哮喘发病机制的多项基础研究。

        肺血管疾病专科：本专业组主要诊治范围包括：各种类型肺动脉高压，肺栓塞等。目前常规开展的项目有：急性肺栓塞溶栓治疗，右心导管检查，肺动脉造影，6分钟步行试验，肺动脉高压靶向治疗等专科诊疗技术。从提高肺栓塞的诊断意识入手，使肺栓塞的诊断率明显提高；在全院开展住院患者血栓栓塞评分预测制度及预防治疗制度，减少了住院患者特别是围手术期患者肺栓塞发生率及致死率。

        胸部疾病综合治疗亚专科：本专业组致力于肺部肿瘤、胸膜疾病、肺间质性疾病以及各种类型气管-支气管瘘的研究和治疗，为呼吸系统疑难病、少见病患者提供医疗服务。